メモリの増設、64bitRでの認識
昨日注文したメモリがもう届きました。
アマゾンすげーな。
PCの横を開けて、メモリスロットに差し込む。
再起動すると、、、
ちゃんとメモリが8Gになりました!
64bitRを起動してメモリチェックすると、、、
memory.limit() [1] 8119
Rもちゃんとメモリを認識してます。
ちなみに特別な設定は全くしてません。
ついでに32bitRでも同じように確認してみました。
memory.limit() [1] 3583
おお、やっぱりこれが限界なんだね。
メモリが増える最大の利点は、より大きなデータ(ベクトルや行列)を扱うことができるようになることだと思う。
単純な推定、アルゴリズム計算とか、シミュレーションとかのスピードはCPU依存だからメモリ増やしても変わらないよね(多分)。
それぞれの場合に扱える最大データの大きさはまた調査しますかぁ。
マイクロアレイは前からできてたけど、GWASのデータとかも行列としてゴリゴリ計算できたらいいな~。
あ、マイクロアレイも3,000サンプルのヒートマップは描けなかったな。
3,000サンプル×20,000遺伝子は扱えなかったんですよ。
3,000サンプル×6,000遺伝子のヒートマップは、前のPCでも描けたんですけどね。